¿Tú estuviste enferma ayer?

In this case the verb "estar" is used because the subject is in a variable state, not permanent.
In this case, the simple past tense is used since we have a certain time "ayer" (yesterday).
The simple past tense of the indicative of the verb "estar":
- Yo estuve
- Tú estuviste
- Usted estuvo
- Él estuvo
- Ella estuvo
- Nosotros/as estuvimos
- Vosotros/as estuvisteis
- Ustedes estuvieron
- Ellos/as estuvieron