Lo más importante es que se haya manejado bien todo el proyecto.
After analyzing the verbs:
- Lo más importante es que se haya manejado bien todo el proyecto. ⇝ Compound past perfect (subjunctive mood)
- La conclusión es que se ha logrado cumplir con los objetivos. ⇝ Compound past perfect (indicative mood)
- Todo ha sido gracias a una buena planificación.
- Se delegaron las tareas necesarias. ⇝ Compound past perfect (indicative mood)
Remember that the subjunctive mood is used when a sentence expresses desire or uncertainty.
Note: I leave you an attached image with the conjugation of the past perfect composed of the subjunctive mood.